Algunos autores, tienden a diferenciar a José Pizarro y a José Alfonso Pizarro como dos individuos distintos. Tal circunstancia se debe, a que las fuentes históricas en la exposición de datos parecen distinguir los hechos realizados, situación que da lugar a cierta confusión, sin embargo, contrastando los expedientes de la época llegamos a la conclusión de que se trata de la misma persona. Pizarro nació en Zamora, capital, pero ignoramos su fecha exacta de igual forma que la de su fallecimiento que fue posterior a 1753, por tanto, su vida transcurrió entre los reinados de los dos primero reyes Borbones, Felipe V y Fernando VI. Era descendiente de una familia noble (marqueses de Villar) y perteneció a la Orden de San Juan de Jerusalén tan extendida por nuestra provincia, motivo por el que, hallándose en la isla de Malta, ingresó en la Armada en 1717 como alférez de navío comenzando así su excelente carrera en Marina. Sus primeras actuaciones tuvieron lugar en el mar Mediterráneo participando, entre otras, en Italia (Sicilia) y en la captura de dos barcos piratas berberiscos que, desde las costas de Argelia donde se refugiaban, atacaban continuamente a los barcos españoles. Después de diversos ascensos, llegó a teniente general en 1746. Durante cierto tiempo estuvo también a las órdenes del célebre marino español, Bias de Lezo, héroe en Cartagena de Indias (Colombia) que en 1741 logró rechazar a los ingleses, de aquí que unos años más tarde al ser trasladado a este país, le acompañara el ingeniero Ignacio de sala que tenía como misión reparar las murallas de la ciudad colombiana. Pizarro, el 30 de marzo de 1749, fue nombrado por el monarca Fernando VI, virrey, gobernador, capitán general civil y militar así como presidente de la Real Audiencia del Nuevo Reino de Granada (Colombia), en sustitución de Sebastián de Eslava que cesaba por enfermedad. El cargo lo ejerció durante cuatro años, hasta 1753, fecha en que se le ordenó regresar a la Península. Los documentos del Archivo General de Indias (Sevilla) nos dicen que el 21 de agosto de aquel año, salió directamente desde el Puerto de Santa María (Cádiz) a su nuevodestino en la fragata "Nuestra Señora del Carmen". Aparte de los pertrechos que llevaba, iba acompañado de su familia y de su séquito. Este último compuesto de veinte personas en el que se cita, no solo la filiación de sus miembros, sino también de sus cargos y características físicas que para nosotros hoy, resultan sumamente curiosas ("narices fargas, cerrado de barba, pequeño de cuerpo, ojos pardos, etc.). En la relación aparecen también dos personas de Benavente: José Diguja y Quiñones, teniente coronel del Ejército y Manuel Calderón, su criado.
De la actuación en América sabemos que su palacio estuvo situado en Santa Fe de Bogotá, y que desde aquí, dirigió tanto su audiencia como la de Panamá que, por mandato Real, se anexionó a la de Santa Fe; fundó varios pueblos a la orilla del río Magdalena con presidiarios traídos de diferentes lugares, incluso desde la misma Península; desarrolló la cultura entre las gentes que habitaban en las tierras que controlaba y fundó una Academia Universitaria en Panamá que estuvo bajo la supervisión de los jesuitas; independientemente de ésto, se preocupó sobre todode la evangelización de los indios guajiros de la provincia de Santa Marta. Pizarro, junto al Marqués de Casinas, es autor de una obra titulada "Reglamento general de inventarios pora los navíos desde 28 codos de manga hasta 20 inclusive, que se deberán practicar en los Reales arsenales de los departamentos de S.M. en Cádiz", que se conserva en el Archivo-Biblioteca del Ministerio de Marina (Madrid). También, por su cargo de virrey, mandó hacer una serie de mapas algunos de los cuales se encuentran en la Biblioteca Nacional de Madrid. Fue sucedido en el Virreinato por José de Salís Folch.
