Otra parte importante del trabajo es el estudio de la migración postnupcial de paseriformes. Durante los meses de agosto, septiembre y los primeros días de octubre, miles de pequeñas aves migratorias utilizan la Reserva de Villafáfila en su camino de regreso hacia los lugares de invernada en África. Los estudios de la migración otoñal mediante el sistema de anillamiento científico, se vienen realizando en la Casa del Parque desde hace más de una década. El trabajo actual «va a permitir ampliar las zonas de muestreo a algunos hábitats de la Reserva que nunca antes se habían prospectado, así como prolongar en gran medida el periodo de estudio». Para esta labor de anillamiento se han utilizado redes japonesas o de niebla y cepos malla, manejados por anilladores expertos. Se ha procedido al anillado sistemático de todos los ejemplares posibles mediante una anilla metálica oficial con remite del Ministerio de Medio Ambiente.

Además de estas actuaciones el convenio entre la Consejería de Medio Ambiente y La Caixa prevé actuaciones por un importe total de 50.000 euros y en las que participarán 5 personas en riesgo de exclusión social. Se trata de la protección de plantas existentes en el humedal, conservación de infraestructuras, adecuación de charcas y recuperación y limpieza de áreas degradadas.