La Confederación Hidrográfica del Duero (CHD) ha atendido la petición formulada en varias ocasiones por el Ayuntamiento de Toro y ha ejecutado diversos trabajos de limpieza de las riberas y del cauce del río Duero a su paso por Toro, con el objetivo de eliminar la maleza y residuos acumulados en el paraje natural y evitar posibles daños estructurales en el puente de piedra. El Ayuntamiento presentó a la CHD una memoria que recogía diversas intervenciones en el entorno del puente de piedra, relacionadas con la conectividad fluvial y la necesaria limpieza de las riberas, en las que no se había actuado desde hace años con la consiguiente acumulación de maleza, residuos y vegetación. El proyecto fue incluido por la CHD dentro del programa de mejora hidrológica de los cauces de la provincia y, al margen de la limpieza de las riberas hasta el puente de hierro, también estaba previsto eliminar una isla del cauce que, con el paso del tiempo, se ha formado con grava y maleza. Finalmente, como explicó la concejala de Obras, Ruth Martín, la CHD ha decidido no eliminar por completo la isla central creada en el cauce, sino que ha procedido a canalizar el agua alrededor de la isleta después de ampliar los dos ramales que la bordeaban. Esta decisión responde, según Martín, a que la CHD ha considerado que "era mejor" mantener parte de la isla para evitar posibles daños en el puente de piedra porque, ante una crecida del caudal del río, el agua rebosa hacia atrás y rebotaría, por lo que los empujes se dirigirían a las pilas y a la plataforma de hormigón del restaurado monumento.
En el marco de la actuación que ha ejecutado la CHD, según la concejala de Obras, también se han llevado a cabo labores de desbroce y de limpieza en las riberas del Duero que han permitido retirar gran cantidad de troncos de madera, aunque también se ha realizado una poda selectiva, un "entresaque" del material forestal y un aclareo de vegetación en ambas márgenes del río. Del mismo modo, la actuación ha permitido eliminar especies vegetales consideradas invasoras que han desplazado a otras autóctonas de la zona y que tan solo retenían una gran cantidad de material de depósito. Por último, Martín resaltó la importancia de la intervención ejecutada por la CHD para preservar tanto el restaurado puente de piedra como su entorno natural en el que, desde hace años, no se ejecutaban trabajos de limpieza o desbroce, a pesar de la gran cantidad de material de depósito que se había acumulado y que aumentaban el riesgo de que el monumento sufriera daños.
